অর্থ মন্ত্রণালয়ের ১৯৮৫ সালের একটি স্মারক বলে হিসাব মহানিয়ন্ত্রকের কার্যালয় স্থাপিত হয়। পূর্বে এটি এজি অফিস (সিভিল) নামে পরিচিত ছিল। ব্রিটিশ আমলে ১৯৪৭ সালে স্থাপিত, “অফিস অফ দ্য অ্যাকাউন্টস জেনারেল” হল এর মূল ভিক্তি। সিজিএ অফিস গঠনের ফলে বাংলাদেশের সরকারি হিসাব ব্যবস্থা বিভাগীয়করণের সুযোগ সৃষ্টি হয়। এর ফলে মহাহিসাব নিরীক্ষক ও নিয়ন্ত্রক মন্ত্রণালয় বা বিভাগের অ্যাকাউন্টসগুলোর উন্নয়ন ও প্রস্তুত করার দায়িত্ব থেকে অব্যাহতি পায়। সিজিএ অফিস মহাহিসাব নিরীক্ষক ও নিয়ন্ত্রক মহোদয়ের নির্দেশনা মোতাবেক স্বাধীনভাবে অর্থ বিভাগের প্রশাসনিক নিয়ন্ত্রনে কাজ করে যার জন্য সিজিএ অফিস এককভাবে দায়বদ্ধ। এটি বাংলাদেশ সরকারের মাসিক হিসাব, অর্থ অনুমোদন ও অ্যাকাউন্ট তৈরি করে। সকল সিভিল অফিসার এবং সরকারী সংস্থার দাবির দায় পরিশোধ এবং নিজ নিজ অফিসগুলোর প্রাথমিক হিসাব প্রস্তুত করার জন্য বিভাগীয় হিসাব সম্পাদক, জেলা হিসাবরক্ষণ কর্মকর্তা এবং উপজেলা হিসাবরক্ষণ কর্মকর্তাদের কাজ তত্ত্বাবধান করে।

এরই আলোকে হিসাবরক্ষণ ব্যবস্থা শক্তিশালী করার জন্য ১৪/০২/১৯৯৯ খ্রিঃ তারিখে সিএএফও/বাংলাদেশ জাতীয় সংসদ সচিবালয় প্রতিষ্ঠা লাভ করে। প্রতিষ্ঠালগ্ন থেকে এটি বাংলাদেশ জাতীয় সংসদ সচিবালয়ের আর্থিক কার্যাবলী সূচারুরূপে সম্পন্ন করার মাধ্যমে হিসাবায়ন ব্যবস্থা শক্তিশালী করে এবং গতিশীলতা নিয়ে আসে। এই অফিস বর্তমানে হিসাব ভবন সেগুনবাগিচার ৩য় লেনে ৪র্থ (লিফ্ট এর ৩য়) তলায় অবস্থিত।